吉林工商学院校医院是负责学校卫生安全和为师生提供基本医疗服务工作的专门机构，主要职责是为全校师生员工提供疾病诊疗、传染病防控、健康教育以及应对公共卫生突发事件等工作。

校医院设有内科、外科、皮肤科，中医科、检验科、医学影像科等诊疗科室，还有医务科、预防保健科、护理科、药剂综合科等行政科室，共有专业技术人员20余名。

校医院在学校党委领导下，加强医院管理和医德医风建设，全面提高医务人员业务水平，医护人员、卫技人员每年参加各类医学继续教育学习活动，坚持“预防为主、防治结合”的工作方针，时刻牢记“一切为了师生，全心全意为师生服务“的宗旨，积极探索卫生服务的新模式，努力让教职工满意，让学生满意，竭诚为全校师生员工的健康保驾护航，为建设高水平大学贡献力量。